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锐谈 「 Metab. Eng.:IPP旁路甲戊酸途径出产异戊烯醇的高通量酶筛选平台

锐谈 「 Metab. Eng.:IPP旁路甲戊酸途径出产异戊烯醇的高通量酶筛选平台

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  • 发布时间:2023-12-01 13:49
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锐谈 「 Metab. Eng.:IPP旁路甲戊酸途径出产异戊烯醇的高通量酶筛选平台

【概要描述】

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异戊烯醇是生物燃料中的一种,异戊二烯等商品化学品的前体。

现在已知在大肠杆菌中通过甲羟戊酸道路道路出产异戊烯醇,产量为理论最大值的70%。

本文基于甲羟戊酸二磷酸脱羧酶的混杂活性开垦基于IPP旁路的异戊烯醇路线。

一.MVA途径及不足

一分子MVA由两步磷酸化转变为一分子MVAPP,消耗两分子ATP,始末脱羧酶PMD天生一分子IPP,消耗一分子ATP,图。

综上通过MVA门路生产一分子IPP需要消耗三分子ATP,同时IPP水解时磷酸基团会被白搭,同时IPP积累会按捺大肠杆菌生长。

MVA途径因为异戊烯基二磷酸的毒性,及ATP的高需求量,提高产率。

二.IPP旁路途径

文章改进:本文改用甲羟戊酸二磷酸脱羧酶(PMD)的混杂活性开发基于IPP旁路的异戊烯醇途径。

采用异源表达酿酒酵母PMD酶脱羧MVAP酿成磷酸异戊烯基(IP」,此路线能够降低IPP毒性,并降低ATP的消耗,图「B」。

同时PMDsc对非天然底物MVAP的活性低,因而需构建PMD的突变菌株,提高活性。
三.构建筛选平台

将宿主菌株生长速率与PMD酶脱羧速率耦合,筛选PMD突变体。

方案:

1. 在培植基中添补MEP门路按捺剂Fosmidomycin,按捺MEP门路,阻断发作IPP和MAPP的唯一门路,图「B」。

2. PMDsc的杂沓酶活性,与IPP、二甲基焦磷酸烯丙酯DMAPP的造成相耦合。

3. 增加按捺MEP途径的抗生素消除内源性MEP途径爆发的IPP,只有异源IPP旁路的表达大肠杆菌本领发展。

步骤1:

对比报道中三种对IP有活性的激酶EcIPK、MtIPK、TaIPK在DH1菌株野生型中表达,对比得出MtIPK活性最高。

结论:优化了大肠杆菌DH1只能从由MVA道路旁路道路中产生的IPP中存活,验证了细胞滋长仅依赖于异源表达的IPP旁路中MVAP的脱羧反映。
(图a)
步骤2:

三种PMDsc突变体的动力学测定,R74H突变体活性最好,同时滋长速度最快。

结论:成长速率服从MVAP脱羧活性和PMDsc的表达程度而变化。
(图b)

四.筛选平台的应用

构建好举座筛选平台的底层菌株后,对PMDsc构建酶文库,验证多种分歧的PMDsc突变体在构建好的筛选平台前提下酶活性、菌株成长速度与产物滴度具有的关联性,「表2」。
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ymben.2017.03.010

作者:祭

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