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锐谈「 Nat. Commun：利用合成sRNA 在百般细菌中进行靶向和高通量基因敲低

分类：新闻动态
作者：Chow
来源：
发布时间：2023-09-08 15:34
访问量：

锐谈「 Nat. Commun：利用合成sRNA 在百般细菌中进行靶向和高通量基因敲低

【概要描述】

分类：新闻动态
作者：Chow
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发布时间：2023-09-08 15:34
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产业生物技术应用中，高效的微生物细胞工场依赖于微调代谢和调控网络使用可复生资源出产各式化学品，但通过染色体操刁难潜在基因靶标的鉴定和测试验证是费时劳累。比如CRISPRi等反式作用的靶基因敲低体例，不妨在转录程度上快捷敲低靶基因，而无需染色体独霸，近来的Mobile-CRISPRi体例可用于敲低区别细菌中的靶基因。然而，因为Cas9蛋白引起的代谢负荷，基于CRISPR的工具在细菌中的实际应用偶然受到限制。

比来，韩国国度科学与工程院院士Sang Yup Lee和他的团队在Nature Communications 通信上发表了题为“Targeted and high-throughput gene knockdown in diverse bacteria using synthetic sRNAs”的研究，汇报了一种适用于多种细菌的sRNA平台的开垦，该平台由sRNA支架和来自枯草芽孢杆菌的Hfq卵白构成，其多功能性可看成多种细菌中的基因敲低工具。看成该sRNA体例的代谢工程应用，通过靶基因的组合敲低，开垦了没关系产生戊内酰胺和邻氨基苯甲酸甲酯的高本能机能谷氨酸棒状杆菌菌株；构建了掩盖2959 C. glutamicum基因组尺度的sRNA文库，用于高产靛蓝菌株的高通量比色筛选，获得了迄今为止没关系生产最高滴度靛蓝的菌株。

运用枯草芽孢杆菌的RoxS和Hfq构成的BHR-sRNA体系，不妨方便灵验的敲低一十六种差别细菌物种的基因，包含致病菌、共生菌、益生菌或财产菌株，表明了这种sRNA技术的广泛适用性；该体系可用于飞快鉴别基因敲低靶标，以增加强学品的生产。本查究证明，BHR-sRNA平台是一种普遍适用的合成生物学和代谢工程工具包，不妨兑现、高效、准确和高通量的敲低差别细菌中的基因靶标。